록맨 에그제 비스트 플러스

'그레이거'와 '페르저'와의 전투를 마치고, '네트'와 친구들은 비욘다드에서 다시 일상으로 돌아온다.
그러나 전투가 끝난지 얼마지 않아, 이번에는 전자 데이터가 실체화 된 전뇌식물과 야수화 바이러스들이 사람들을 공격하기 시작하는데!
네트는 야수화 바이러스를 쓰러뜨리지만, 이번엔 미확인 존재 '제로'가 등장한다. 그리고 제로를 조종하는 것은... 교수?!
대체 이 교수는 누구인가? 교수가 제로를 조종하는 명분은?